Introducción. Las transformaciones realizadas en sistema nacional de salud han variado la cantidad de recursos humanos en las unidades, lo cual significa un potencial cambio de la escala de operación y de los niveles de eficiencia. Objetivos. Determinar el nivel de eficiencia de cada clínica estomatológica de Matanzas entre los años 2007 y 2011, identificar las unidades de mejor práctica, identificar las potencialidades para mejorar la eficiencia y describir el efecto de las medidas organizacionales sobre la eficiencia. Método. Investigación descriptiva retrospectiva en las 10 clínicas estomatológicas de la provincia. Se emplearon tres indicadores de resultados y dos de recursos. Se utilizó el análisis envolvente de datos bajo el modelo de maximización de resultados y rendimientos variables a escala. Resultados. El valor medio de eficiencia técnica fue 70%. Sólo tres unidades se mantuvieron como eficientes durante todo el periodo. Dos de siete unidades ineficientes debieron a su condición a la escala de operaciones. Las unidades tendieron a funcionar en condiciones de rendimientos crecientes. "Leonilda Soumbil"se identificó como unidad de mejor práctica. Las unidades ineficientes deben mejorarse los resultados y disminuir el gasto de los recursos. Las acciones de compactación redundaron en una disminución de los niveles de eficiencia. Conclusiones. Los niveles de ineficiencia técnica son elevados. Las disminuciones globales del gasto en salud no garantizan la eficiencia institucional. Lograr instituciones eficientes conlleva aunar las disminuciones del gasto, con el análisis de los resultados alcanzados, en comparación con otras similares y de acuerdo a las escalas de producción.