Introducción: La evaluación de la competencia didáctica de los profesores de la carrera Estomatología, es fundamental y decisiva para alcanzar una participación activa del personal docente en la formación de los estudiantes, con eficiencia y calidad, lo cual tiene una gran repercusión en la atención estomatológica a la población. Objetivo: Proponer una metodología que contribuya al perfeccionamiento del proceso de evaluación de la competencia didáctica de los profesores de la carrera Estomatología de la Universidad de Ciencias Médicas de Sancti Spíritus. Materiales y métodos: Se realizó una investigación con enfoque mixto donde se emplearon métodos del nivel teórico, empírico y estadístico. Se evaluó la contribución de la metodología al perfeccionamiento del proceso de evaluación de la competencia didáctica orientado hacia el perfil del profesor de la carrera Estomatología, mediante un pre-experimento. Resultados: De un nivel muy bajo en la pre-prueba ascendió al nivel muy alto en la post-prueba, resultado que coincidió con el de las sesiones en profundidad. Conclusiones: Se pone de manifiesto el cambio favorable que se produce en el proceso de evaluación de la competencia didáctica con la implementación de la metodología, expresado en el nivel de apropiación, por ejecutivos y profesores, de conocimientos, formas de proceder y vivencias afectivas, sustentado en el carácter sistémico, sistemático, objetivo y formativo de este proceso evaluativo, orientado en función de la mejora y hacia el perfil del profesor de Estomatología.