Introducción: La automedicación en el ámbito estomatológico es una práctica frecuente que compromete la seguridad y la integridad de los pacientes. Objetivo: Describir los resultados de la actividad docente de la asignatura Farmacología sobre el perfil de la automedicación en los pacientes atendidos en las Clínicas Estomatológicas de la Facultad de Estomatología “Raúl González Sánchez”. Material y Método: En la Facultad de Estomatología de la Universidad de Ciencias Médicas de la Habana se realizó un estudio descriptivo en el mes de abril del 2019. Los profesores de Farmacología elaboraron un cuestionario denominado: Perfil de la automedicación en Estomatología, a partir de la modificación de dos instrumentos aplicados por sus autores, para promover una actuación que contribuya a la prescripción racional de los medicamentos. El cual se aplicó por los estudiantes de la carrera de Estomatología. Resultados: De 119 pacientes encuestados, el 78,99% se automedicaban para afecciones estomatológicas. La edad promedio de estos pacientes fue de 41,87 años y predominó del sexo femenino (67,02%). El principal motivo de la automedicación fue aliviar el dolor dental (86,17%), la razón más frecuente fue la experiencia personal anterior con el uso del medicamento (56,48%), y el origen primordial de la recomendación fue de algún familiar (31,82%). Los grupos farmacológicos que se automedicaron fundamentalmente fueron analgésicos (60,39%), antibióticos (14,93%) y ansiolíticos (12,99%). Conclusiones: La automedicación constituye un importante problema de salud en Estomatología, que suponen un área de trabajo prioritaria desde la docencia hacia la prescripción responsable y el consumo adecuado de los medicamentos.