Introducción. Las micobacterias son agentes infecciosos que han acompañado al hombre durante años. Estos microorganismos pueden  provocar  infecciones pulmonar como extrapulmonar, siendo la infección pulmonar  la más frecuente, aunque no podemos descartar las infecciones  extrapulmonares  las cuales se pueden diagnosticar a partir de diferentes tipos de muestras,  como: orina, líquido cefalorraquídeo, pleural, ascítico, sangre, entre otros. Objetivo. El objetivo de nuestro trabajo fue destacar la importancia diagnóstica de las  infecciones urinarias  producidas por  micobacterias, ya que en muchos casos no se piensa en este tipo de infección. Materiales y Métodos. Se analizaron 157 muestras  de orina, recibidas en el Laboratorio Nacional de Referencia e Investigaciones de  Tuberculosis,  Lepra y Micobacterias en el periodo  de enero 2011  a julio 2014. Las muestras fueron procesadas por  el método de  ácido sulfúrico al 4% , para  luego ser cultivadas en  medio   Löwenstein-Jensen,  la clasificación e identificación se  realizó aplicando las técnicas fenotípicas–bioquímicas recomendadas. Resultados. De las  157 muestras se obtuvieron   27 (17.2%)   aislamientos micobacterianos; 7(4.5%) aislamientos de  Mycobacterium tuberculosis (5 VIH positivo y  2 VIH negativo,  y 20 (12.7%) aislamientos de micobacterias no tuberculosas (6VIH positivo y 14 VIH negativo).  Las especies micobacterianas  aisladas fueron: Mycobacterium avium-intracellulare  (17), Mycobacterium malmoense  (2),  y  Mycobacterium szulgai (1). Conclusión. Estos resultados demuestran  que se debe mantener estos estudios, y especial interés clínico a los aislamientos micobacterianos en muestras de orina,  especialmente en pacientes VIH/sida pues en ellos las consecuencia de estas infecciones pueden ser fatales.